灵芝又名灵芝草、仙草，是一种能延年益寿，具有良好保健效果的药用真菌，被视为吉祥之物，长寿的象征，故有瑞草之美称。利用沼气发酵残留物瓶栽灵芝，可比常规的麸皮、棉籽壳瓶栽灵芝降低成本1/3左右，而且产量高。
1.选取沼渣
必须选用投料3个月、正常产气的沼气池中取出的沼渣，取出后放在塑料薄膜上摊晾，要求沼渣无完整的柴草秸秆、有稠密的小孔、无粪臭气味；用于瓶栽灵芝的沼渣含水量应在60%左右。
2.选择菌种
必须选择优良的灵芝菌种，才能获得高产高效。优良的菌种，接种15天就可形成子实体，每只子实体可达50g左右；差的菌种，需30天左右才能形成子实体，每只子实体只有7－10g。
3.科学配料
按沼渣3000g、棉籽壳2880g、糖120g、水635g配比配料。由于沼渣有一定的黏性，同时杂草和秸秆等在沼气池中经发酵，弹性明显变差，导致通气性差，不利于菌丝下扎。所以，在沼渣中加入50%左右的棉籽壳，能克服透气性差和弹性不好的缺点。配制时，应将各种原料放在塑料薄膜上或适当的容器中，充分拌合均匀。
4.细心装料
选用透明广口瓶，培养料装量不应超过瓶子高度的3/4。在装瓶时，边装边拍，适度拍实培养料，把料面制平，并用木条或其他细棒打洞，深度约达料厚的2/3，然后再把木条转退出来。装瓶后，洗净外壁粘着的培养料，塞上棉塞即可进行蒸煮消毒。蒸煮时间为6小时，蒸煮后，放在蒸笼中让其自然冷却后即可接种。
5.无菌接种
把已消毒且冷却至30℃以下的培养料瓶移至接种间或接种箱中。接种瓶应倒立于接种箱内，或接种间的桌上。接种箱或接种间事先用高锰酸钾或甲醛消毒，并用高锰酸钾溶液消毒接种用具，用肥皂洗净手。接种时扒掉菌种表面的菌皮，菌种瓶的瓶口放在酒精灯火焰的周围，用镊子取一块菌种迅速接入待接种的瓶内，放在培养料表面的洞口，棉塞过酒精灯火焰后塞好瓶口，即完成一瓶接种，如此往复操作至接完种。接种量一般为一瓶菌种接种40瓶。
6.培养和管理
（1）、调适pH值pH值以4－6最为适宜，超出这一范围菌丝就不能生长。
（2）、控制温湿 将接种后的瓶子放入培养室中培养。温度控制在24－30℃，相对湿度为85－90%。如发现杂菌污染应予淘汰。灵芝菌丝生长的适宜温度为12－36℃，以27℃最好；形成菌盖和子实体的最适温度则为22℃。瓶内小气候的湿度一般适宜于灵芝菌丝体的生长，打开瓶塞后，空气相对湿度以保持80－90%为宜。
（3）、满足漫射光 灵芝菌丝在黑暗环境中均能正常生长。但在灵芝子实体生长分化过程中，需要较多的漫射光，而且灵芝还有正向光性。一般栽培室深不超过8m，前后两面需有较多的玻璃窗，若是平房，最好再开1－2个天窗。
（4）、开瓶增氧 灵芝为好氧性真菌，打开瓶塞后，要有充足的新鲜空气。
7.分批采收
灵芝成熟的标志是边缘色泽由淡黄色转成红色。采收灵芝时，应在边缘转红前，用锋利的小刀齐瓶口割下，刀要快，切口要平，采收后晒干至含水量10－12%，袋装置于干燥的室内保存或出售。瓶裁灵芝采收1次后，停止喷水2－3天，提高湿度至90－95%，温度保持在26－28℃，可在原来柄上继续生长灵芝子实体，故第1次采收时，子实体不宜留得过老。按照前法培养管理，约25天后可采收第2茬灵芝，一般可采收3－4茬。采完后的培养料还可作肥料。
